Животный мир Северных Апеннин, в том числе и Сан-Марино, сильно обеднен. Гораздо лучше, чем крупные млекопитающие, сохранились в Сан-Марино грызуны: белки, сони, полевые мыши и крысы. Сохранились в небольшом числе серна, косуля, барсук, куница, ласка. В зарослях маквиса иногда встречаются кабаны. Возле населенных пунктов обитают заяц, истребляющий капусту и морковь, и лисица, охотящаяся на кур. В каштановых рощах можно увидеть прыгающих с дерева на дерево белок. Крестьянским хозяйствам много хлопот доставляют быстро размножающиеся кролики, их отстреливают и употребляют в пищу.
И в Сан-Марино, и в Италии подлинно национальной страстью является ловля птиц. Особенно активно санмаринцы ловят различных голубей, гнездящихся в пещерах и на развалинах, пугливых витютеней, живущих в рощах, египетских голубей, прилетающих весной из Африки, и проворных горлиц.
В Сан-Марино можно часто наблюдать, как хищные птицы — орлы, коршуны, соколы, ястребы-перепелятники неподвижно парят в воздухе, выискивая добычу.
Встречается здесь даже такая редкая птица Средиземноморья, как турач (другое название — франколин, что в переводе означает «по закону не может быть убитым»). Эта птица из семейства фазановых похожа на крупную курицу. У самца спина буроватая с пестринками, на шее — коричневый ободок, самка окрашена менее ярко.
В начале лета в долинах Сан-Марино можно услышать целые хоры соловьев, малиновок, черных дроздов, коноплянок и зябликов. Много цикад, которые умолкают лишь тогда, когда свои песни заводит соловей, но стоит ему оборвать мелодию, как цикады снова начинают стрекотать.
В речках и ручьях встречаются щуки, лини, голавли, а также форели и хариусы.